Wolfgang Baumgratz, wurde in Meersburg/Bodensee geboren, er studierte Kirchenmusik Heidelberg (Orgel bei Wolfgang Dallmann) und Freiburg (Orgel bei Ludwig Doerr) und legte
1976 das A-Examen ab. 1976 bis 1978 studierte er als Stipendiat des DAAD bei Albert de Klerk in Amsterdam und absolvierte dort 1978 das Solisten-Examen als Konzertorganist. Weiterführende Studien erfolgten in Meisterkursen bei Tagliavini, Kooiman, Roth, M.C. Alain und Langlais. 1979 wurde er an die Domorganistenstelle in Bremen berufen. Seit 1980 unterricht Wolfgang Baumgratz Orgel an der Hochschule für Künste Bremen, 1984 erfolgte die Ernennung zum Professor, 1989 wurde er Leiter der Kirchenmusik-Abteilung. Von 1990 bis 1992 war er Dirigent des Bach-Chores Delmenhorst/Bremen.
Umfangreiche Konzerttätigkeit führen ihn durch ganz Europa. Er wirkt als Solist bei vielen Orgelfestivals und als Jury-Mitglied bei mehreren Internationalen Orgelwettbewerben mit. Zahlreiche Rundfunk- und Schallplattenaufnahmen mit einem alle Epochen umfassenden Repertoire und mit Improvisationen belegen seine Vielseitigkeit.
In der Internationalen Gesellschaft der Orgelfreunde (GdO) war er ab 1990 Vizepräsident und ist seit Mai 1998 Präsident.